以上的分类方法是根据糜烂的病理学概念进行的。前已述及，宫颈糜烂的原因很多，除与创伤造成宫颈粘膜撕裂、继发细菌感染导致上皮脱落形成糜烂有关外，还与体内内分泌的改变有关，因此又有人将这种类型的糜烂分为先天性糜烂和后天性糜烂。
    1、先天性糜烂：
    在胎儿发育期，除阴道上皮外，其它生殖道上皮皆起源于体腔上皮。当胚胎发育至第3或第4个月时，子宫颈管内的圆柱状上皮和宫颈阴道部表面的鳞状上皮已经可以明显地区分，此时两型上皮的交界处不是在宫口，而是位于子宫颈管内。当胚胎发育至第6-7个月时，宫颈的柱状上皮已具备了分泌功能。在妊娠晚期，这些柱状上皮受母体雌激素的影响，宫颈粘膜柱状上皮增生，开始向宫颈口外方生长，并超越了宫颈外口，因此在新生女婴约有1/3宫颈外观类似成人的宫颈糜烂。由于此时并不存在裂伤、感染等形成宫颈糜烂的因素，故把这种糜烂称为先天性糜烂出生后来自母体的雌激素影响逐渐消退，新生女婴的这种糜烂也自行消退。
    2、后天性糜烂：
    后天性糜烂是和先天性糜烂相对而言，多发生在卵巢功能旺盛的生育年龄妇女，宫颈管柱状上皮受卵巢产生的雌激素影响而出现过度增生，超过宫颈外口，从而使宫颈外口呈糜烂状。此种糜烂的外观与炎症引起的糜烂无异，只是引起糜烂的原因不同而已。这种糜烂多见于妊娠期，产后大部分都能自行消退。由于病因不同，其临床表现多少有一些差异。此类患者的白带也会增多，但白带的性质为清亮粘液状，紧紧贴附于宫颈表面，不易擦掉。病理检查时柱状上皮细胞下没有炎症细胞浸润，而有腺体和间质增生。说明这种糜烂可能和内分泌改变有一定联系，而和炎症似无直接关系。当然在糜烂的基础上很容易继发炎症感染，但这种炎症表现只是结果，而不是糜烂的原因。